医药主题基金是近两年市场的宠儿，因强悍的“赚钱效应”成为投资者追捧对象。目前医药主题主要有主动管理型基金和被动指数型基金，相对来说主动医药基金靠选股赚钱效应更加明显。
数据显示，目前35只布局医药健康的指数型基金(各类型分开算，仅计算分级基金母基金，含增强指数型产品)今年以来收益为47.85%，而全部纳入统计的67只主动医药基金的平均收益为59.45%，显示出主动和被动之间显著业绩差异。同时，今年业绩最好的指数型基金为招商国证生物医药，收益率为67.66%，但主动医药类基金表现最好的是融通健康产业，收益率达到78.33%，更有多只基金收益率超过70%，表现突出。
若拉长时间来看，医药指数类产品的最近3年、最近5年的收益率分别为64.05%、54.58%，而主动医药基金的同期收益率远远高于指数类产品，分别达到123.09%、145.31%。从数据看，时间越长，主动医药类基金的超额收益越发明显。
一位医药行业基金经理表示，医药指数基金优点在于费率较低，与行业指数的偏离度较小，但缺点是无法根据行业内结构性和趋势性的变化做出主动调整。医药细分子行业非常多，内部差异较大，这两年医药行业又处在转型升级的关键时点，投资逻辑与三四年前相比有了巨大变化，因此细分行业表现差异极大，这正是主动管理型基金可以发挥优势的地方。
上述人士表示，因为主动型基金要想跑赢指数获得超额收益，要么做准仓位选择，要么抓到优质超额收益的个股。对绝大多数公募集基金而言，在仓位选择上做出超额收益的难度远高于个股选择;另外，基金规模也限制了通过仓位选择获得超额收益的空间。所以，公募基金超额收益的关键点还是在于个股选择，这也正是公募基金的优势所在。普通投资者在选择主动管理基金时，主要是挑选基金经理及背后的研究团队。
投资者筛选医药主题基金经理时，注意考察基金经理的学科背景，最好是医药相关行业的专业毕业，这样才能更好掌握医药产品的市场前景、研发难度、风险等内容，如果有行业分析师背景则更好。投资者还要经常关注基金经理的媒体专访，以及仓位集中度、换手率、回撤水平等。此外，也可以关注这只医药基金的机构占比，最好选择机构资金占比在50%左右的基金，这类可能是机构比较认可的基金经理。
此外，医药股往往具有“大年”“小年”的差距，投资者可以重点关注在市场波动中的综合表现，比如在“大年”中能否把握住市场机遇战胜市场，而在“小年”里能否表现抗跌，控制回撤，这往往考验基金经理研究的深度。
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