然而，这一备受两岸工商界关注的协议，协商一年多以来，却数度传出因涉及主权议题而使协商碰上瓶颈，显示两岸协商先易后难，现已进入艰难的阶段。

　　据台湾媒体的报道，两岸于8月5日一连三天在上海就该协议进行关键性会谈，双方在台商人身安全保障与仲裁机制上，碰到有主权争议的政治意涵问题，未能达成共识，双方协商团队不排除在8月底、9月初第7次江陈会签署前，再次举行协商，争取共识。投保协议去年未能顺利签署也是卡在这两个议题的细节上。

　　总统马英九竞选2012年连任的副手，行政院长吴敦义日前接受台湾媒体专访时透露，投资保障协议双方未达共识。他说：“虽然有谈、有改进、有拉近距离，但还不到成熟阶段。”他认为：“签得早不如签得好”，原订8月在大陆举行的七次江陈会，可能延期到9月，政府不会为签而签。

　　经济分析师曾向本报指出，两岸能否在近期签署投保协议将有助于为台湾进一步吸引更多中国大陆投资，对台湾经济有正面影响。台商在大陆投资家数与人数非常多，十分关切投保协议能否尽快签署。台商曾粗略估计，有多达150万台商在大陆居住。据台湾经济部投审会公布的数字，累计至去年年底，台湾对中国投资金额共计973.2亿美元（约1362亿新元），占台湾全部对外投资的59.7%。

　　尽管两岸投保协议的签署将为台湾经济带来正面效应，但碰上涉及主权争议的敏感议题，两岸协商显然需要更多时间取得共识。

　　有关保障投资权益，包含P2P（个人对个人）、P2G（个人对政府）或G2G（政府对政府）等多个层面。投保协议协商一直未取得共识，主要是涉及敏感的主权争议范围。

　　在仲裁机制部分，台湾媒体引述相关官员说，由于政府对政府争端，涉及两岸经济合作架构协议（ECFA）协议内容，与台商投资个案比较无关，将交由ECFA后续协议之一的争端解决机制处理，未规划在第7次陈江会上签署。

　　另一种型态则是政府对投资人（G2P），这也是台商最关切的部分，也是双方拉锯最大的一项议题。中国大陆避讳台湾采用引进国际仲裁机制，而台湾希望公正第三方由国际仲裁机制成员担任，但陆方尚未接受，有待进一步协商。

　　至于人身安保障的议题，据中央社报道，台湾希望在协议附件中叙明以“国民待遇”原则（意即外国人与当地居民有同等待遇）；然而，大陆在意“国民待遇”字眼，要求比照大陆国内刑事诉讼法规定，这点台湾方面也不能接受，双方未达共识。

　　依据大陆《刑事诉讼法》规定，决定拘留、逮捕的机关在拘留、逮捕后，除有碍侦查或无法通知者外，应当把拘留、逮捕的原因和羁押的处所，在24小时内通知被拘留人、被逮捕人的家属或者他的所在单位，但对双边有领事条约的外国人，通知期限则是7天。